Habiendo visto que la realidad y el riesgo de sensibilización y alergia en el intestino es un fenómeno claro que se presenta en los pacientes. Conociendo ya la función de la Barrera intestinal y cómo está perfectamente diseñada para controlar el riesgo, veamos ahora qué pasa, cuál es el fenómeno inmunopatogenia que nos lleva a la sensibilización intestinal.
Lo mas importante es entender que hay factores implicados en la aparición de sensibilización a los alimentos, como pueden ser los rasgos genéticos, la exposición a algún alergeno y/o estímulos medioambientales.
La composición de microflora es determinada durante el período neonatal por las bacterias presentes en el tracto digestivo de la madre.